伊丹憲一(川原和久 飾)帶出云麗音(筱原友希子 飾)和芹澤慶二(山中崇史 飾)去命案現場調查，發現死者笠松剛史被人從正面往心臟開了一槍。笠松剛史是《魔槍錄》的作者，傳聞得到被稱為魔槍的手槍人們，自認為是天選之人，為了拯救世界的使命而戰斗的故事。笠松剛史被殺，角田六郎(山西惇 飾)帶領全員出動，尋找兇手。
青木年男前來告訴杉下右京(水谷豐 飾)和冠城亙(反町隆史 飾)，三個月前用槍擊議員的槍，和《魔槍錄》中描寫的手槍是同一種型號，被稱之為魔槍，根據科搜研的鑒定結果，殺害笠松剛史的子彈，和魔槍的膛線痕完全一致。冠城亙和杉下右京打聽殺害笠松剛史的子彈和魔槍的膛線痕完全一致，而之前用來槍擊議員的魔槍，還在科學警察研究所內。
杉下右京帶冠城亙來到科學警察研究所，找黑巖詢問鑒定結果，黑巖沒有說出鑒定結果，杉下右京和冠城亙又去看三個月前，被保存起來的魔槍。杉下右京看到魔槍完好無損，推測一個是有另外一支手槍跟收藏起來的魔槍，有同樣的膛線痕，還有一種可能，就是鑒定出現了錯誤。
久保冢尊敬黑巖，杉下右京和冠城亙找久保冢了解有關黑巖的一些情況。鑒定結果出來，久保冢帶杉下右京和冠城亙去見黑巖，黑巖告訴杉下右京和冠城亙，兩把槍膛線痕一致，杉下右京斷定，還有另外一把手槍，跟科學警察研究生里的手槍，有著同樣的膛線痕。
伊丹憲一向內村完爾匯報調查結果，內村完爾懷疑跟暴力團伙有關，讓伊丹憲一從暴力團伙這線索開始調查。角田六郎跟杉下右京和冠城亙聊了一會關于魔槍的案子，就忙著去尋找兇手去了。杉下右京不知道原口雄彥是怎么弄到一把與小說描寫完全一致的手槍，特意帶上冠城亙，去盤問原口雄彥，原口雄彥聲稱，手槍不是他弄到的，而是手槍主動找到他。
杉下右京好奇，原口雄彥怎么想到去襲擊楠木議員，原口雄彥解釋，既然沒有人能夠制裁楠木議員，只能用他來動手。冠城亙和杉下右京打聽到，笠松剛史是因為一名女刑警被襲擊，來了靈感，從而寫出有名的《魔槍錄》。出云麗音把笠松剛史撰寫《魔槍錄》時用的參考資料，全部交給杉下右京和冠城亙，冠城亙和杉下右京查閱資料，還是不知道，是誰把槍給了原口雄彥。
冠城亙和杉下右京到小手鞠店里消費的同時，討論魔槍案子。冠城亙和杉下右京拿著笠松剛史參考的論文，找上黑巖，黑巖和久保冢都承認閱讀過論文。杉下右京和冠城亙不能明白，兇手明明離笠松剛史很近，為何還要開槍，于是求助于黑巖。
伊丹憲一看見豐田充鬼鬼祟祟的，從家里出來，身上還背著包，不知道要做什么？于是叫上出云麗音和芹澤慶二，把豐田充抓走。杉下右京分析，豐田充二十六歲，自由職業者，雖然持有手槍，但又不在場的證明，可以確定笠松剛史不是豐田充殺的。
黑巖拿出三個月前，襲擊議員案子中的手槍，還有昨天扣押的手槍，告訴冠城亙和杉下右京，兩把槍的膛線痕截然不同，也就是說，擊中笠松剛史的，是別的手槍，杉下右京覺得難以置信。冠城亙經過黑巖允許，戴上手套，檢查兩把槍，有一把槍上面有汽油味道，黑巖跟冠城亙解釋其原因。
黑巖晚上墜樓死亡，第二天，伊丹憲一帶著出云麗音和芹澤慶二去科學警察研究所調查黑巖死因，在黑巖的辦公室里，發現有寄給笠松剛史粉絲來信復印件，分別來自原口雄彥，豐田充，其中還包括《對犯罪認知以及實行標準》論文的原始數據。
芹澤慶二和出云麗音在杉下右京的提示下，找到實驗對象原口雄彥的名字，由此可以推測，笠松剛史和黑巖之間有聯系。杉下右京推測，黑巖把科警研機密交給笠松剛史，讓笠松剛史寫《魔槍錄》，兩人之間起了糾紛，黑巖從科學警察研究所的保險柜里取出手槍，把笠松剛史射殺了，然后再裝作若無其事地把手槍放回去，但不知道，是誰協助黑巖殺死笠松剛史的？
杉下右京和冠城亙從黑巖辦公室走出來，看見了精神恍惚的久保冢。久保冢差點暈倒，冠城亙扶了久保冢一下，從而聞到久保冢身上，有著跟手槍同樣的味道。冠城亙經過杉下右京同樣，去鑒定科找益子學點東西。杉下右京在青木年男的幫助下，弄清楚案子的真相。
冠城亙和杉下右京帶久保冢去黑巖辦公室，開門見山的說出，久保冢把手槍偷偷帶出科學警察研究生，射殺笠松剛史，就是想驗證渴望力量的人手上有了槍會做出什么？給笠松剛史資料，讓笠松剛史寫出《魔槍錄》的人，也是久保冢。
久保冢在杉下右京和冠城亙的壓迫下，把說出犯罪的經過，以及心理狀態。
